Depende! Pois é, depende da forma como será feita essa venda.
A forma mais segura é realizar a quitação do imóvel, que poderá ser realizada com outro financiamento, assumido pelo comprador.
Por exemplo:
Imóvel vendido por R$ 150.000,00
Saldo devedor no banco: R$ 90.000,00
Saldo para o vendedor: R$ 60.000,00
Outro ponto importante a considerar é o valor do imóvel, considerando o valor atual do mercado e as benfeitorias realizadas.
Ainda, após a venda você precisa se preocupar com a Declaração do Imposto de Renda, que incidirá apenas no lucro. Procure um especialista!